ส่วนกลาง
- สำนักอำนวยการคณะกรรมการตรวจเงินแผ่นดิน
- สำนักผู้ว่าการตรวจเงินแผ่นดิน
- สำนักวิชาการและให้คำปรึกษาการตรวจเงินแผ่นดิน
- สำนักกำกับและส่งเสริมการตรวจเงินแผ่นดิน
- สำนักวินัยการเงินการคลัง
- สำนักกฎหมาย
- สำนักคดี
- สำนักการต่างประเทศ
- สำนักวิจัย
- สำนักนโยบายและแผนการตรวจเงินแผ่นดิน
- สำนักประชาสัมพันธ์และสื่อสารองค์กร
- สำนักการเงินและการคลัง
- สำนักบริหารงานกลาง
- สำนักบริหารทรัพยากรบุคคล
- สำนักตรวจสอบภายใน
- สำนักควบคุมและประกันคุณภาพการตรวจเงินแผ่นดิน
- สถาบันพัฒนาการตรวจเงินแผ่นดิน
- ศูนย์ดิจิทัลและนวัตกรรมการตรวจเงินแผ่นดิน
- สำนักตรวจสอบระบบสารสนเทศ
- สำนักตรวจสอบโครงการขนาดใหญ่
- สำนักตรวจเงินแผ่นดินที่ 1
- สำนักตรวจเงินแผ่นดินที่ 2
- สำนักตรวจเงินแผ่นดินที่ 3
- สำนักตรวจเงินแผ่นดินที่ 4
- สำนักตรวจเงินแผ่นดินที่ 5
- สำนักตรวจเงินแผ่นดินที่ 6
- สำนักตรวจเงินแผ่นดินที่ 7
- สำนักตรวจเงินแผ่นดินที่ 8
- สำนักตรวจเงินแผ่นดินที่ 9
- สำนักตรวจเงินแผ่นดินที่ 10
- สำนักตรวจเงินแผ่นดินที่ 11
- สำนักตรวจเงินแผ่นดินที่ 12
- สำนักตรวจเงินแผ่นดินที่ 13
- สำนักตรวจเงินแผ่นดินที่ 14
- สำนักตรวจเงินแผ่นดินที่ 15
- สำนักตรวจเงินแผ่นดินที่ 16
- สำนักตรวจเงินแผ่นดินที่ 17
- สำนักตรวจเงินแผ่นดินที่ 18
- สำนักตรวจเงินแผ่นดินที่ 19
- สำนักตรวจเงินแผ่นดินที่ 20
- สำนักตรวจเงินแผ่นดินที่ 21
- สำนักตรวจเงินแผ่นดินที่ 22
- สำนักตรวจสอบการปฏิบัติตามกฎหมายที่ 1
- สำนักตรวจสอบการปฏิบัติตามกฎหมายที่ 2
- สำนักตรวจสอบการปฏิบัติตามกฎหมายที่ 3
- สำนักตรวจสอบผลสัมฤทธิ์และประสิทธิภาพการดำเนินงานที่ 1
- สำนักตรวจสอบผลสัมฤทธิ์และประสิทธิภาพการดำเนินงานที่ 2
- สำนักตรวจสอบผลสัมฤทธิ์และประสิทธิภาพการดำเนินงานที่ 3
- สำนักตรวจสอบผลสัมฤทธิ์และประสิทธิภาพการดำเนินงานที่ 4
- สำนักตรวจสอบผลสัมฤทธิ์และประสิทธิภาพการดำเนินงานที่ 5