๑) กำหนดเป้าหมาย ทิศทาง ภารกิจงานตรวจสอบภายในเพื่อสนับสนุนการบริหารงานและการดำเนินงานด้านต่าง ๆ ของสำนักงานการตรวจเงินแผ่นดิน ให้สอดคล้องกับนโยบาย ของสำนักงานการตรวจเงินแผ่นดิน คณะกรรมการตรวจเงินแผ่นดิน และคณะกรรมการตรวจสอบ

๒) กำหนดกฎบัตรไว้เป็นลายลักษณ์อักษร เสนอผู้ว่าการตรวจเงินแผ่นดิน ก่อนเสนอคณะกรรมการตรวจสอบเพื่อพิจารณาให้ความเห็นชอบ และเผยแพร่ให้ส่วนราชการภายในของสำนักงานการตรวจเงินแผ่นดินทราบ

๓) จัดให้มีการประกันและปรับปรุงคุณภาพงานตรวจสอบภายใน ทั้งภายในและภายนอก ตามรูปแบบและวิธีการที่กรมบัญชีกลางกำหนด

๔) จัดทำและเสนอแผนการตรวจสอบภายในประจำปีต่อผู้ว่าการตรวจเงินแผ่นดิน ก่อนเสนอคณะกรรมการตรวจสอบ เพื่อพิจารณาอนุมัติ

๕) ปฏิบัติงานตรวจสอบให้เป็นไปตามแผนการตรวจสอบภายในประจำปีที่ได้รับอนุมัติ และสรุปผลการตรวจสอบการปฏิบัติงานตามแผนการตรวจสอบประจำปีรายงานต่อผู้ว่าการตรวจเงินแผ่นดิน คณะกรรมการตรวจสอบ และคณะกรรมการตรวจเงินแผ่นดิน

๖) จัดทำและเสนอรายงานผลการตรวจสอบต่อผู้ว่าการตรวจเงินแผ่นดิน และคณะกรรมการตรวจสอบ

๗) ติดตามผลการตรวจสอบ เสนอแนะ และให้คำปรึกษาแก่ส่วนราชการภายในของสำนักงานการตรวจเงินแผ่นดิน

๘) จัดทำรายงานผลการดำเนินงานของคณะกรรมการตรวจสอบ เสนอคณะกรรมการ ตรวจเงินแผ่นดิน

๙) ปฏิบัติงานอื่นที่เกี่ยวข้องกับการตรวจสอบภายในตามหลักเกณฑ์ที่กระทรวงการคลังกำหนด

๑๐) ปฏิบัติงานร่วมกับหรือสนับสนุนการปฏิบัติงานของส่วนราชการภายในอื่นที่เกี่ยวข้อง

๑๑) ปฏิบัติหน้าที่อื่นตามที่คณะกรรมการตรวจเงินแผ่นดิน หรือผู้ว่าการตรวจเงินแผ่นดินมอบหมาย